后来发现不仅是前台、微信不能登录，后台管理员同样不能登录。

排查下来发现是系统更新里面新增的HttpOnly部分造成的，暂时解决方案是修改app\common.php里面function set_cookie部分的header("Set-Cookie: {$cookie}",false);    替换成 cookie($name,$value,$option);   就恢复正常了。

//header("Set-Cookie: {$cookie}",false);     
cookie($name,$value,$option);

最终为什么header("Set-Cookie: {$cookie}",false);造成无法登录的原因还不清楚。